دام‌داران و مزرعه‌دارانی که می‌خواهند برای تاسیس یا اصلاح نژاد در گله یا مزرعه خود از قوچ همو یا هترو استفاده کنند باید مواردی را مدنظر داشته باشند. برخی از این موارد نکاتی است که از سالیان گذشته و در دام‌پروری سنتی نیز رواج داشته است و در مورد استفاده از دام‌های اصلاح نژادی که مختص به صنعت دام‌پروی و دام‌داری مدرن هستند نیز، درست بوده و مورد استفاده قرار می‌گیرند. از جمله این موارد باید به عدم اختلاط همیشگی قوچ‌ها با میش‌ها اشاره کرد. چه این میش همو باشد چه هترو یا میش معمولی. این مورد نکته‌ای است که شاید اولین بار توسط دام‌دارانی لحاظ شده باشد که مزرعه دام‌پروری ایجاد کردند. با نگه‌داری گوسفند در مزرعه و اصطلاحاً یکجانشین شدنِ دام‌دار، او به مضرات حضور همیشگی نرها در کنار ماده‌ها پی برد. اکنون که قوچ هموزیگوت یا هتروزیگوت جای قوچ‌های معمولیِ گذشته را گرفته‌اند نیز هنوز این آسیب‌ها و مضرات پابرجا هستند و دام‌داران و مزرعه‌داران باید از این اختلاط جلوگیری کنند. آسیب‌های حضور همیشگی گوسفندان نر در کنار گوسفندان ماده شامل موارد زیر است.

از آن‌جایی که گوسفندان نر ممکن است برای تغذیه بهتر یا دستیابی به میشی خاص با یکدیگر درگیر شده و به زد و خورد بپردازند، بهتر است که در کنار ماده‌ها و بره‌ها نباشند. آسیبی که این درگیری متوجه گله یا مزرعه می‌کند این است که درگیری بین نرها می‌تواند سلامت آن‌ها را به خطر بیندازد و آسیب یا آسیب‌های جبران‌ناپذیری را متوجه خودشان بکند. در مرحله بعد این درگیری می‌تواند میش‌ها و بره‌ها را نیز متوجه آسیب بدنی بکند. به‌خصوص بره‌ها که از لحاظ ساختار و قدرت بدنی ضعیف هستند ممکن است به راحتی در درگیری بین دو قوچ زیر دست‌وپا مانده و تلف شوند. ضرر دیگر این درگیری برای گله یا مزرعه این مورد است که زد و خورد بین قوچ‌ها باعث ایجاد استرس در بره‌ها و ماده‌ها خواهد شد و این استرس اجازه تغذیه مناسب را به آن‌ها نخواهد داد و گله از رشد طبیعی و نرمال خودش باز خواهد ماند.

از جمله فواید دیگر جداسازی و عدم اختلاط گوسفندان نر و ماده در یک مزرعه یا گله باید به نکته‌ای اشاره کرد که در روش دام‌پروری سنتی کمتر مورد توجه بوده است و آن هم اقدام به جفت‌گیری بیش از حد است. در این مورد باید دقت داشت که اگر قوچ نر – چه قوچ همو باشد چه یک قوچ معمولی – به صورت تمام‌وقت در میان گله یا مزرعه رها باشد، احتمال دارد که در هر شبانه‌روز با تعداد زیادی از گوسفندان ماده اقدام به جفت‌گیری نماید. این عمل باعث بروز دو ایراد در مزرعه یا گله می‌شود. ایراد اول آن است که با توجه به انرژی زیادی که انجام آمیزش از نرها می‌گیرد انجام بی‌رویه آن به شدت بر قوت بدنی آن‌ها تاثیر گذاشته و گوسفند ضعیف شده و از رشد طبیعی خود باز خواهد ماند. ایراد دوم این اتفاق نیز این مورد است که وقتی تعداد دفعات جفت‌گیری برای یک قوچ معمولی یا قوچ هموزیگوت زیاد باشد احتمال اینکه بسیاری از این جفت‌گیری‌ها ناموفق بوده و در نهایت به تشکیل نطفه ختم نشود، بسیار زیاد می‌شود. دقت به این نکته از آن‌جایی مهم است که همان‌طور که می‌دانیم هر میش هترو یا همو یا گوسفند ماده دوره فحلی محدودی دارد و بعد از طی شدن این دورهِ چند روزه میش مورد نظر امکان باروری را از دست می‌دهد تا دوره فحلی بعدی از راه برسد. چنانچه قوچی که به صورت کنترل نشده در گله حضور دارد با این میش یا این میش‌ها آمیزش کند و به دلیل انجام زیاد جفت‌گیری، توان باروری خود را از دست داده باشد، این میش یا میش‌ها بارور نخواهند شد و با توجه به اتمام دوره فحلی دوران آبستنی و زایمان آن‌ها حداقل برای یک ماه عقب خواهد افتاد که این کار در نهایت به ضرر دام‌دار خواهد بود.

مورد دیگری که باعث می‌شود توصیه به عدم اختلاط قوچ‌ها با میش‌ها بکنیم این مورد است که در هنگام حضور همیشگی قوچ در گله یا مزرعه، امکان آن وجود دارد که یک میش خاص از لحاظ جنسی برای یک قوچ جذابیت بیشتری پیدا کرده و گوسفند نر اصرار به آمیزش با آن میش داشته باشد. آسیبی که این اتفاق به گله یا مزرعه وارد خواهد کرد این است که در ابتدا ممکن است میش مورد نظر در اثر ازدیاد آمیزش آسیب بدنی ببیند و مورد بعدی هم که موجب یک ضرر کلی‌تر در گله یا مزرعه خواهد شد از دست رفتن دوره فحلی و فرصت آمیزش برای دیگر گوسفندان ماده است. توضیح این آسیب به این شکل است که فرض کنیم دام‌دار با رها کردن قوچ در بین میش‌ها در دوره فحلی مطمئن باشد که جفت‌گیری بین قوچ با میش‌ها انجام می‌شود، ولی با توجه به داشتن جذابیت بیشتر و توجه بیشتر قوچ معمولی یا قوچ همو مورد نظر به یک گوسفند مادهِ خاص، این قوچ از آمیزش با دیگر میش‌هایی که فحل شده‌اند خودداری می‌کند و علاوه بر امکان آسیب بدنی به یک میش، فرصت جفت‌گیری و باروری را از دیگر میش‌هایی که آماده عمل جفت‌گیری هستند را هم می‌گیرد.

با توجه به نکاتی که گفته شد بهتر است افرادی که به دنبال داشتن گوسفند چندقلوزا و دوقلوزا یا قوچ‌های ژن‌دار در مزرعه یا گله خود هستند از قوچ هموزیگوت یا هترو استفاده کنند تا مزایای بسیار زیاد این عمل را در کسب و کار خود ببینند در ضمن در مورد نکاتی که درباره عدم اختلاط نرها با ماده‌ها در مزرعه و گله گفته شد هم باید دقت کافی را به خرج دهند و بدانند که در این مورد فرقی بین قوچ همو یا هترو با قوچ‌های معمولی نیست و آسیب‌های این موارد می‌تواند متوجه این گوسفندان اصلاح نژاد شده نیز باشد.